Seit 2006 wird das interuniversitäre Bachelor- und Masterstudium Musikologie angeboten. Das Studium kann mit Zulassung als ordentliche Studierende oder als ordentlicher Studierender an der Universität für Musik und Darstellende Kunst Graz (KUG) oder an der Universität Graz und "Mitbelegung" an der jeweils anderen Universität absolviert werden.

Die Studierenden erwerben die Fähigkeit, Prozesse, Sachverhalte und Methoden verschiedener Teilbereiche der Musikologie zu verstehen und zu deuten. Darüber hinaus bietet die Universität für Musik und Darstellende Kunst Graz (KUG) ein stilistisch breit gefächertes Spektrum von Musikpraktika an. Die Ausbildung dient sowohl der theoretischen sowie praktischen Einführung und Vertiefung in musikwissenschaftliches Verstehen und Argumentieren als auch der Vorbereitung auf Berufsfelder der Wissenschaft und des Kulturbetriebs.

Schwerpunkte des Studiums sind Ethnomusikologie, Jazz und Popularmusik, Musik in der Geschichte, Musikästhetik sowie Musikpsychologie und Akustik. Der Master-Schwerpunkt im Bereich Pop, Musik und Medienkultur wird seit 2018 nicht mehr angeboten. Relevante Inhalte dieses früheren Schwerpunkts finden sich nun im Schwerpunkt Jazz und Popularmusik.